Gerra Zibila piztu bitartean sei Kongresu egin ziren, gai monografikoei buruzkoak gehienak. Hego Euskal Herrian EIren jarduera debekatu zuten lau hamarkadetan beste bi Kongresu antolatu zituzten, Baionan eta Miarritzen. Azkenik, 1983tik aurrera erregulartasunez egiten ari diren Kongresuetan, euskal gizarteak aurre egin beharreko erronka handiak aztertzen dira, diziplina anitzeko ikuspegi batetik.
2005eko azaroaren 29 eta 30ean eta abenduaren 1ean Eusko Ikaskuntzaren XVI. Kongresua ospatu zen Bilboko Euskalduna Jauregian. Honako goiburuarekin:
“GARAPEN IRAUKORRA - IT. etorkizuna”